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对于未收录于功能标记库中的感兴趣性状、基因,通过查阅科技文献、各数据库信息,挖掘多态性位点,开发分子标记,使用景肽生物自主研发PARMS SNP分型试剂进行基因分型。
本服务包括分子标记的开发流程、送检样本的分型分析流程。
• 标记开发流程
根据供目标位点的物理位置或序列,挑选候选位点,开发候选分子标记。
需提供至少两个、在目标位置存在差异的测试样本,验证候选分子标记的可行性。
每轮次开发周期为5工作日。若候选分子标记未通过验证,则需增加开发轮次。
• 样本分析流程
周期与送检样本量有关,均不包含种子发芽
• 样本数≤96×100,7-10工作日
• 样本数>96×100,10-20工作日
成功开发的分子标记信息
出具《分子标记分析报告》
• 全部送检样本的分型结果(.xlsx),包含检出基因型及其对应的理论表现型
• 各分子标记的分型图(若结果过多,仅提供部分代表性分型图)
可接受DNA、种子、叶片等多种样本类型。
对于叶片类型样本,可另行提供适配的装样板,使用更便捷。
样本类型* | 要求 |
种子 | 确保发芽率 |
DNA | 琼脂糖凝胶电泳有明显条带,浓度10~100ng/μl |
叶片或等效物 | 保持干净、干燥、未腐烂 |
*仅限非人源样本
Q1:需开发分子标记,但只知道目标基因或区段、不清楚具体的变异位点,怎么办?
A1:请至变异位点挖掘了解详情。
Q2:为什么叶片样本无需冷藏、冷冻,寄送时也无需使用冰袋?
A2:使用景肽生物自主研发高效能聚合酶,有极高的灵敏度和特异性,常温样本即可满足扩增要求。样本最重要的是保持干燥,可最大限度的避免叶片存放、运输过程中的腐烂。
• Tan C, Yang Y. Penta-Primer Amplification Refractory Mutation System (PARMS) with Direct PCR-Based SNP Marker-Assisted Selection (D-MAS)[M]//Plant Genotyping: Methods and Protocols. New York, NY: Springer US, 2023: 327-336.
• Lu J, Hou J, Ouyang Y, et al. A direct PCR–based SNP marker–assisted selection system (D-MAS) for different crops[J]. Molecular breeding, 2020, 40: 1-10.