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根据科技文献中记载的各物种种质资源序列信息,挑选多个具有代表性的SNP分子标记作为候选位点,构建背景池,使用背景池内分子标记进行分型,以判断送检材料是否存在混杂

现已建立14个物种的背景池,可直接用于对应物种种子纯度分析。对于未收录于清单中的物种提供纯度分析定制开发服务。




服务目录


物种

背景池标记数

物种

背景池标记数

水稻

24

花椰菜

19

玉米

20

萝卜

20

番茄

27

黄瓜

14

辣椒

12

冬瓜

24

茄子

23

南瓜

44

大白菜

19

甜瓜

12

菠菜

34

西瓜

19




服务流程

含种子发芽,服务周期10个工作日。





结果交付

出具《种子纯度分析报告


• 明确送检材料中是否存在异常个体、异常个体数目


• 判断异常个体类型,母本型杂株、父本型杂株、其他型杂株


• 纯度计算


每个送检材料随机提供至少188个个体样本,如有亲本更佳。


样本类型*

要求

种子

确保发芽率

DNA

琼脂糖凝胶电泳有明显条带,浓度10~100ng/μl

叶片或等效物

保持干净、干燥、未腐烂


                                        *仅限非人源样本




装样建议





Q1:为什么叶片样本无需冷藏、冷冻,寄送时也无需使用冰袋?

A1: 使用景肽生物自主研发高效能聚合酶,有极高的灵敏度和特异性,常温样本即可满足扩增要求。样本最重要的是保持干燥,可最大限度的避免叶片存放、运输过程中的腐烂。




参考文献

• Tan C, Yang Y. Penta-Primer Amplification Refractory Mutation System (PARMS) with Direct PCR-Based SNP Marker-Assisted Selection (D-MAS)[M]//Plant Genotyping: Methods and Protocols. New York, NY: Springer US, 2023: 327-336.

• Lu J, Hou J, Ouyang Y, et al. A direct PCR–based SNP marker–assisted selection system (D-MAS) for different crops[J]. Molecular breeding, 2020, 40: 1-10.