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对于未收录于纯度分析清单中的物种,通过查阅科技文献中记载的种质资源序列信息,挖掘、设计、筛选适用的SNP分子标记,使用该标记进行分型以判断送检样品是否存在混杂,同时建立对应物种的背景池。
本服务包括分子标记的开发流程、送检样本的分型分析流程。
• 标记开发流程
查阅公开资料,挑选候选位点,开发候选分子标记。
需提供至少两个、具有较大差异的测试样本,以两个亲本为最佳,验证候选分子标记的可行性。
每轮次开发周期为5工作日。若候选分子标记未通过验证,则需增加开发轮次。
• 样本分析流程
含种子发芽,周期10个工作日。
成功开发的分子标记信息
出具《种子纯度分析报告》
• 明确送检种子中是否存在异常个体、异常个体数目
• 异常个体类型,母本型杂株、父本型杂株、其他型杂株
• 纯度计算
每个送检杂交种随机提供至少188个个体样本,如有亲本更佳。
样本类型* | 要求 |
种子 | 确保发芽率 |
DNA | 琼脂糖凝胶电泳有明显条带,浓度10~100ng/μl |
叶片或等效物 | 保持干净、干燥、未腐烂 |
*仅限非人源样本
Q1:为什么叶片样本无需冷藏、冷冻,寄送时也无需使用冰袋?
A1:使用景肽生物自主研发高效能聚合酶,有极高的灵敏度和特异性,常温样本即可满足扩增要求。样本最重要的是保持干燥,可最大限度的避免叶片存放、运输过程中的腐烂。
• Tan C, Yang Y. Penta-Primer Amplification Refractory Mutation System (PARMS) with Direct PCR-Based SNP Marker-Assisted Selection (D-MAS)[M]//Plant Genotyping: Methods and Protocols. New York, NY: Springer US, 2023: 327-336.
• Lu J, Hou J, Ouyang Y, et al. A direct PCR–based SNP marker–assisted selection system (D-MAS) for different crops[J]. Molecular breeding, 2020, 40: 1-10.